Index

A

abstract_group() (in module alien.classes) add_slice() (in module alien.utils) alias() (in module alien.utils) alien module alien.benchmarks module alien.benchmarks.metrics module alien.benchmarks.oracle module alien.benchmarks.retrospective module alien.benchmarks.uncertainty_metrics module alien.classes module alien.data module, [1] alien.data.dataset module alien.data.deepchem module alien.decorators module alien.models module alien.models.keras module alien.models.keras.keras module alien.models.keras.utils module alien.models.pytorch module alien.models.pytorch.last_layer module alien.models.pytorch.pytorch module alien.models.pytorch.training_limits module alien.models.pytorch.utils module

alien.sample_generation module alien.sample_generation.filter_generator module alien.sample_generation.from_set module alien.sample_generation.generator module alien.sample_generation.random_generator module alien.sample_generation.transformation module alien.selection module alien.stats module alien.utils module any_get() (in module alien.utils) any_pop() (in module alien.utils) append() (alien.benchmarks.metrics.RMSE method) (alien.benchmarks.metrics.Score method) (alien.benchmarks.metrics.TopScore method) (alien.data.dataset.ArrayDataset method) (alien.data.dataset.DictDataset method) (alien.data.dataset.NumpyDataset method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset method) (alien.data.dataset.TeachableDataset method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset method) (alien.data.dataset.TorchDataset method) (alien.data.dataset.TupleDataset method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset method) ArrayDataset (class in alien.data.dataset) as_DCDataset() (in module alien.data.deepchem) as_list() (in module alien.utils) as_numpy() (in module alien.utils) as_tensor() (in module alien.models.pytorch.utils) augment_ensemble() (in module alien.stats) average_runs() (alien.benchmarks.metrics.RMSE static method) (alien.benchmarks.metrics.Score static method) (alien.benchmarks.metrics.TopScore static method) axes_except() (in module alien.utils)

B

BAITSelector (class in alien.selection) batch_limit() (alien.models.pytorch.training_limits.StdLimit method) (alien.models.pytorch.training_limits.TrainingLimit method) batch_shape (alien.data.dataset.ArrayDataset property) (alien.data.dataset.Dataset property) (alien.data.dataset.DictDataset property) (alien.data.dataset.NumpyDataset property) (alien.data.dataset.ShuffledDataset property) (alien.data.dataset.TeachableDataset property) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset property) (alien.data.dataset.TorchDataset property) (alien.data.dataset.TupleDataset property) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset property)

batches (alien.models.pytorch.training_limits.StdLimit attribute) (alien.models.pytorch.training_limits.TrainingLimit attribute) best_multiple() (in module alien.benchmarks.uncertainty_metrics) binary_optimize() (in module alien.benchmarks.uncertainty_metrics)

C

CachedDict (class in alien.utils) check_Xy() (alien.data.dataset.ArrayDataset method) (alien.data.dataset.Dataset method) (alien.data.dataset.DictDataset method) (alien.data.dataset.NumpyDataset method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset method) (alien.data.dataset.TeachableDataset method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset method) (alien.data.dataset.TorchDataset method) (alien.data.dataset.TupleDataset method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset method) chunks (class in alien.utils) clear() (alien.utils.SelfDict method) compute() (alien.benchmarks.metrics.RMSE method) (alien.benchmarks.metrics.Scatter method) (alien.benchmarks.metrics.TopScore method) compute_bdim() (in module alien.data.dataset)

concatenate() (in module alien.utils) conf_int() (in module alien.benchmarks.metrics) copy() (alien.utils.SelfDict method) covariance() (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) covariance_ensemble() (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) covariance_from_ensemble() (in module alien.stats) covariance_from_similarity() (in module alien.stats) covariance_laplace() (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) covariance_linear() (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) CovarianceRegressor (class in alien.models) CovarianceSelector (class in alien.selection)

D

data (alien.models.keras.keras.KerasRegressor property) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization property) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor property) Dataset (class in alien.data.dataset) DeepChemDataset (class in alien.data.deepchem) default_decorator() (in module alien.decorators) default_filename (alien.benchmarks.metrics.RMSE attribute) (alien.benchmarks.metrics.Score attribute) (alien.benchmarks.metrics.TopScore attribute) diagonal() (in module alien.utils)

dict_get() (in module alien.utils) dict_pop() (in module alien.utils) DictDataset (class in alien.data.dataset) do_normalize() (in module alien.decorators) docs module dot_last() (in module alien.utils) dropout_call() (in module alien.models.keras.utils) dropout_forward() (in module alien.models.pytorch.utils) dtype (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor property)

E

embedding_method (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization property) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor property) ensemble_from_covariance() (in module alien.stats) EnsembleRegressor (class in alien.models) epochs (alien.models.pytorch.training_limits.StdLimit attribute) (alien.models.pytorch.training_limits.TrainingLimit attribute) extend() (alien.data.dataset.ArrayDataset method) (alien.data.dataset.DictDataset method) (alien.data.dataset.NumpyDataset method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset method) (alien.data.dataset.TeachableDataset method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset method) (alien.data.dataset.TorchDataset method) (alien.data.dataset.TupleDataset method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset method)

extend_shuffle() (alien.data.dataset.ShuffledDataset method)

F

feature_shape (alien.data.dataset.ArrayDataset property) (alien.data.dataset.Dataset property) (alien.data.dataset.DictDataset property) (alien.data.dataset.NumpyDataset property) (alien.data.dataset.ShuffledDataset property) (alien.data.dataset.TeachableDataset property) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset property) (alien.data.dataset.TorchDataset property) (alien.data.dataset.TupleDataset property) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset property) Filter (class in alien.sample_generation.filter_generator) final() (in module alien.classes) find() (alien.data.dataset.ArrayDataset method) (alien.data.dataset.Dataset method) (alien.data.dataset.DictDataset method) (alien.data.dataset.NumpyDataset method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset method) (alien.data.dataset.TeachableDataset method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset method) (alien.data.dataset.TorchDataset method) (alien.data.dataset.TupleDataset method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset method) find_last_layer() (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) find_method() (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) fit() (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.Model method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) (alien.models.Regressor method) fit_laplace() (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) fit_model() (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.Model method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) (alien.models.Regressor method)

fit_uncertainty() (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.Model method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) (alien.models.Regressor method) fix_dropouts() (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) flatten() (in module alien.utils) flatten_batch() (in module alien.decorators) frac_enum() (in module alien.utils) from_csv() (alien.data.deepchem.DeepChemDataset static method) from_data() (alien.data.dataset.ArrayDataset static method) (alien.data.dataset.Dataset static method) (alien.data.dataset.DictDataset static method) (alien.data.dataset.NumpyDataset static method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset static method) (alien.data.dataset.TeachableDataset static method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset static method) (alien.data.dataset.TorchDataset static method) (alien.data.dataset.TupleDataset static method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset static method) from_deepchem() (alien.data.dataset.ArrayDataset static method) (alien.data.dataset.DictDataset static method) (alien.data.dataset.NumpyDataset static method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset static method) (alien.data.dataset.TeachableDataset static method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset static method) (alien.data.dataset.TorchDataset static method) (alien.data.dataset.TupleDataset static method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset static method) from_df() (alien.data.deepchem.DeepChemDataset static method) from_folder() (alien.benchmarks.metrics.RMSE static method) fromkeys() (alien.utils.SelfDict method)

G

generate_sample() (alien.benchmarks.oracle.SetOracle method) (alien.sample_generation.filter_generator.Filter method) (alien.sample_generation.from_set.SetSampleGenerator method) (alien.sample_generation.from_set.WrappedGenerator method) (alien.sample_generation.generator.SampleGenerator method) (alien.sample_generation.random_generator.RandomSampleGenerator method) (alien.sample_generation.random_generator.UniformSampleGenerator method) (alien.sample_generation.transformation.TransformedSampleGenerator method) generate_samples() (alien.benchmarks.oracle.SetOracle method) (alien.sample_generation.filter_generator.Filter method) (alien.sample_generation.from_set.SetSampleGenerator method) (alien.sample_generation.from_set.WrappedGenerator method) (alien.sample_generation.generator.SampleGenerator method) (alien.sample_generation.random_generator.RandomSampleGenerator method) (alien.sample_generation.random_generator.UniformSampleGenerator method) (alien.sample_generation.transformation.TransformedSampleGenerator method) get() (alien.utils.SelfDict method) get_args() (in module alien.decorators) get_defaults_from_self() (in module alien.decorators) get_featurizer() (alien.data.deepchem.DeepChemDataset static method)

get_label() (alien.benchmarks.oracle.Oracle method) (alien.benchmarks.oracle.SetOracle method) get_labels() (alien.benchmarks.oracle.Oracle method) (alien.benchmarks.oracle.SetOracle method) get_lightning_trainer() (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) get_mod_layers() (in module alien.models.keras.utils) get_prefilter() (alien.selection.CovarianceSelector method) get_shuffle() (alien.data.dataset.ArrayDataset method) (alien.data.dataset.DictDataset method) (alien.data.dataset.NumpyDataset method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset method) (alien.data.dataset.TeachableDataset method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset method) (alien.data.dataset.TorchDataset method) (alien.data.dataset.TupleDataset method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset method) get_training_limit() (in module alien.models.pytorch.training_limits) get_weights() (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) get_Xy() (in module alien.decorators) group_edges() (in module alien.stats) group_sizes() (in module alien.stats)

H

humble_batchnorm_call() (in module alien.models.keras.utils)

I

init_bias() (in module alien.models.pytorch.pytorch) init_subclass() (in module alien.classes) init_weights() (in module alien.models.pytorch.pytorch) initialize() (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.Model method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) (alien.models.Regressor method)

input_embedding() (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) is_iterable() (in module alien.utils) is_one() (in module alien.utils) isint() (in module alien.utils) items() (alien.utils.SelfDict method)

J

join() (in module alien.utils)

joint_entropy() (in module alien.stats) joint_entropy_regularized() (in module alien.stats)

K

KerasRegressor (class in alien.models.keras.keras) keys() (alien.utils.SelfDict method)

KL_divergence() (in module alien.benchmarks.uncertainty_metrics) KmeansSelector (class in alien.selection)

L

labels (alien.benchmarks.oracle.SetOracle property) (alien.sample_generation.from_set.SetSampleGenerator property) last_layer_embedding() (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) LastLayerPytorchLinearization (class in alien.models.pytorch.last_layer) linearization() (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) load() (alien.benchmarks.metrics.RMSE static method) (alien.benchmarks.metrics.Scatter static method) (alien.benchmarks.metrics.Score static method) (alien.benchmarks.metrics.TopScore static method) (alien.models.CovarianceRegressor static method) (alien.models.EnsembleRegressor static method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor static method) (alien.models.Model static method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization static method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor static method) (alien.models.Regressor static method)

load_many() (alien.benchmarks.metrics.RMSE static method) (alien.benchmarks.metrics.Score static method) (alien.benchmarks.metrics.TopScore static method)

M

match() (in module alien.utils) max_epochs (alien.models.pytorch.training_limits.StdLimit attribute) (alien.models.pytorch.training_limits.TrainingLimit attribute) max_samples (alien.models.pytorch.training_limits.StdLimit attribute) (alien.models.pytorch.training_limits.TrainingLimit attribute) method_names (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization attribute) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor attribute) min_epochs (alien.models.pytorch.training_limits.StdLimit attribute) (alien.models.pytorch.training_limits.TrainingLimit attribute) min_samples (alien.models.pytorch.training_limits.StdLimit attribute) (alien.models.pytorch.training_limits.TrainingLimit attribute) Model (class in alien.models) model_predict() (alien.selection.BAITSelector method) (alien.selection.CovarianceSelector method) (alien.selection.KmeansSelector method) (alien.selection.RandomSelector method) (alien.selection.TimestampSelector method) modify_dropout() (in module alien.models.keras.utils) module alien alien.benchmarks alien.benchmarks.metrics alien.benchmarks.oracle alien.benchmarks.retrospective alien.benchmarks.uncertainty_metrics alien.classes alien.data, [1] alien.data.dataset alien.data.deepchem alien.decorators alien.models alien.models.keras alien.models.keras.keras alien.models.keras.utils alien.models.pytorch alien.models.pytorch.last_layer alien.models.pytorch.pytorch alien.models.pytorch.training_limits alien.models.pytorch.utils alien.sample_generation alien.sample_generation.filter_generator alien.sample_generation.from_set alien.sample_generation.generator alien.sample_generation.random_generator alien.sample_generation.transformation alien.selection alien.stats alien.utils docs

multiply_std_dev() (in module alien.stats) multisearch() (in module alien.utils)

N

ndim (alien.data.dataset.ArrayDataset property) (alien.data.dataset.Dataset property) (alien.data.dataset.DictDataset property) (alien.data.dataset.NumpyDataset property) (alien.data.dataset.ShuffledDataset property) (alien.data.dataset.TeachableDataset property) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset property) (alien.data.dataset.TorchDataset property) (alien.data.dataset.TupleDataset property) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset property) (alien.models.CovarianceRegressor property) (alien.models.EnsembleRegressor property) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor property) (alien.models.Model property) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization property) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor property) (alien.models.Regressor property)

NEED() (in module alien.decorators) no_default() (in module alien.utils) no_recursion() (in module alien.decorators) normalize_args() (in module alien.decorators) NumpyDataset (class in alien.data.dataset)

O

Oracle (class in alien.benchmarks.oracle)

override() (in module alien.classes)

P

parent_locals() (in module alien.classes) plot() (alien.benchmarks.metrics.Scatter method) plot_errors() (in module alien.benchmarks.uncertainty_metrics) plot_scores() (in module alien.benchmarks.metrics) pop() (alien.utils.SelfDict method) popitem() (alien.utils.SelfDict method) predict() (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.Model method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) (alien.models.Regressor method) predict_ensemble() (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method)

predict_linear() (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) predict_samples() (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.Model method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) (alien.models.Regressor method) predict_with_embedding() (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) prediction_prior() (alien.selection.BAITSelector method) (alien.selection.CovarianceSelector method) (alien.selection.KmeansSelector method) (alien.selection.RandomSelector method) (alien.selection.TimestampSelector method) PytorchRegressor (class in alien.models.pytorch.pytorch)

R

RandomSampleGenerator (class in alien.sample_generation.random_generator) RandomSelector (class in alien.selection) ranges() (in module alien.utils) RecursionContext (class in alien.decorators) Regressor (class in alien.models) remove_data_indices() (alien.benchmarks.oracle.SetOracle method) (alien.sample_generation.from_set.SetSampleGenerator method) remove_sample() (alien.benchmarks.oracle.SetOracle method) (alien.sample_generation.from_set.SetSampleGenerator method) remove_samples() (alien.benchmarks.oracle.SetOracle method) (alien.sample_generation.from_set.SetSampleGenerator method) reshape() (alien.data.dataset.ArrayDataset method) (alien.data.dataset.Dataset method) (alien.data.dataset.DictDataset method) (alien.data.dataset.NumpyDataset method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset method) (alien.data.dataset.TeachableDataset method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset method) (alien.data.dataset.TorchDataset method) (alien.data.dataset.TupleDataset method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset method) (in module alien.utils)

reshape_batch() (alien.data.dataset.ArrayDataset method) (alien.data.dataset.DictDataset method) (alien.data.dataset.NumpyDataset method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset method) (alien.data.dataset.TorchDataset method) (alien.data.dataset.TupleDataset method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset method) reshape_features() (alien.data.dataset.ArrayDataset method) (alien.data.dataset.DictDataset method) (alien.data.dataset.NumpyDataset method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset method) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset method) (alien.data.dataset.TorchDataset method) (alien.data.dataset.TupleDataset method) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset method) reshuffle() (alien.benchmarks.oracle.SetOracle method) (alien.data.dataset.ShuffledDataset method) (alien.sample_generation.from_set.SetSampleGenerator method) RMSE (class in alien.benchmarks.metrics) RMSE() (alien.benchmarks.metrics.Scatter method) run_experiments() (in module alien.benchmarks.retrospective)

S

sample_limit() (alien.models.pytorch.training_limits.StdLimit method) (alien.models.pytorch.training_limits.TrainingLimit method) SampleGenerator (class in alien.sample_generation.generator) samples (alien.models.pytorch.training_limits.StdLimit attribute) (alien.models.pytorch.training_limits.TrainingLimit attribute) SampleSelector (class in alien.selection) save() (alien.benchmarks.metrics.RMSE method) (alien.benchmarks.metrics.Scatter method) (alien.benchmarks.metrics.Score method) (alien.benchmarks.metrics.TopScore method) (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.Model method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) (alien.models.Regressor method) save_initial_weights() (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) Scatter (class in alien.benchmarks.metrics) Score (class in alien.benchmarks.metrics) search_lower() (in module alien.benchmarks.uncertainty_metrics) search_upper() (in module alien.benchmarks.uncertainty_metrics) seed_all() (in module alien.utils) select() (alien.selection.BAITSelector method) (alien.selection.CovarianceSelector method) (alien.selection.KmeansSelector method) (alien.selection.RandomSelector method) (alien.selection.SampleSelector method) (alien.selection.TimestampSelector method) SelfDict (class in alien.utils) sem() (in module alien.benchmarks.metrics) set_last_layer() (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) set_weights() (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) setdefault() (alien.utils.SelfDict method) SetOracle (class in alien.benchmarks.oracle) SetSampleGenerator (class in alien.sample_generation.from_set)

shape (alien.data.dataset.ArrayDataset property) (alien.data.dataset.Dataset property) (alien.data.dataset.DictDataset property) (alien.data.dataset.NumpyDataset property) (alien.data.dataset.ShuffledDataset property) (alien.data.dataset.TeachableDataset property) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset property) (alien.data.dataset.TorchDataset property) (alien.data.dataset.TupleDataset property) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset property) (alien.models.CovarianceRegressor property) (alien.models.EnsembleRegressor property) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor property) (alien.models.Model property) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization property) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor property) (alien.models.Regressor property) shift_seed() (in module alien.utils) ShuffledDataset (class in alien.data.dataset) sig_append() (in module alien.decorators) similarity_cosine() (in module alien.stats) similarity_exp() (in module alien.stats) similarity_gaussian() (in module alien.stats) std_dev() (alien.models.CovarianceRegressor method) (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.pytorch.last_layer.LastLayerPytorchLinearization method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) std_dev_ensemble() (alien.models.EnsembleRegressor method) (alien.models.keras.keras.KerasRegressor method) (alien.models.pytorch.pytorch.PytorchRegressor method) std_dev_from_ensemble() (in module alien.stats) std_keys() (in module alien.utils) StdLimit (class in alien.models.pytorch.training_limits) submodules() (in module alien.models.pytorch.utils) subobjects() (in module alien.models.keras.utils) sum_except() (in module alien.utils)

T

TeachableDataset (class in alien.data.dataset) TeachableWrapperDataset (class in alien.data.dataset) TimestampSelector (class in alien.selection) TopScore (class in alien.benchmarks.metrics)

TorchDataset (class in alien.data.dataset) TrainingLimit (class in alien.models.pytorch.training_limits) TransformedSampleGenerator (class in alien.sample_generation.transformation) tuple (alien.data.dataset.TupleDataset property) TupleDataset (class in alien.data.dataset)

U

ufunc() (in module alien.utils) UniformSampleGenerator (class in alien.sample_generation.random_generator)

update() (alien.utils.SelfDict method) update_copy() (in module alien.utils)

V

values() (alien.utils.SelfDict method)

W

WrappedGenerator (class in alien.sample_generation.from_set)

X

X (alien.data.dataset.ArrayDataset property) (alien.data.dataset.Dataset property) (alien.data.dataset.DictDataset property) (alien.data.dataset.NumpyDataset property) (alien.data.dataset.ShuffledDataset property) (alien.data.dataset.TeachableDataset property) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset property) (alien.data.dataset.TorchDataset property) (alien.data.dataset.TupleDataset property) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset property)

Y

y (alien.data.dataset.ArrayDataset property) (alien.data.dataset.Dataset property) (alien.data.dataset.DictDataset property) (alien.data.dataset.NumpyDataset property) (alien.data.dataset.ShuffledDataset property) (alien.data.dataset.TeachableDataset property) (alien.data.dataset.TeachableWrapperDataset property) (alien.data.dataset.TorchDataset property) (alien.data.dataset.TupleDataset property) (alien.data.deepchem.DeepChemDataset property)

Z

zip_dict() (in module alien.utils)